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Assessment of genetic diversity on a sample of cocoa accessions resistant to witches' broom disease based on RAPD and pedigree data Bragantia
Santos,Ronaldo Carvalho dos; Pires,José Luís; Lopes,Uilson Vanderley; Gramacho,Karina Peres G.; Flores,Acassi Batista; Bahia,Rita de Cássia S.; Ramos,Helaine C. Cristine; Corrêa,Ronan Xavier; Ahnert,Dario.
Genetic diversity in cocoa (Theobroma cacao L.) has been assessed based on morphological and molecular markers for germplasm management and breeding purposes. Pedigree data is available in cocoa but it has not been used for assessing genetic relatedness. The geneitic diversity of 30 clonal cocoa accessions resistant to witche´ broom disease, from the CEPEC series, were studied on the basis of RAPD data and pedigree information. Twenty of these accessions descend from the TSA-644 clone, originated from a cross between the Upper Amazon germplasm called Scavina-6, the main source of resistance to witches' broom disease, and IMC-67. The ten remaining clones come from different sources including Amazon and Trinitario germplasm. RAPD data was collected using 16...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coefficient of parentage; Molecular markers.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052005000300005
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Caracterização de linhagens endogâmicas recombinantes e mapeamento de locos de características quantitativas associados a ciclo e produtividade do feijoeiro-comum PAB
Faleiro,Fábio Gelape; Schuster,Ivan; Ragagnin,Vilmar Antônio; Cruz,Cosme Damião; Corrêa,Ronan Xavier; Moreira,Maurílio Alves; Barros,Everaldo Gonçalves de.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar 154 linhagens endogâmicas recombinantes por meio da avaliação de características quantitativas, morfológicas, moleculares e de resistência a doenças e mapear locos de características quantitativas associados a ciclo e produtividade do feijoeiro-comum. Adotando o valor do limite de detecção (LOD) de 4,0 e uma freqüência máxima de recombinação de 0,40, foram mapeados 43 marcadores em nove grupos de ligação cobrindo uma distância de recombinação total de 247,8 cM. A distância entre marcadores adjacentes variou entre 0 e 28 cM, com média de 7,3 cM. Os grupos de ligação variaram em tamanho de 2,3 a 61,2 cM. Os genes de resistência à ferrugem e à antracnose ficaram localizados no mesmo grupo de ligação. Foram mapeados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; QTL; Mapa genético; Progênie; Marcador genético; Método de melhoramento.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2003001200005
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Cucumber mosaic virus resistance and reproductive biology of brazilian melon accessions Rev. Bras. Frutic.
Sanabria-Verón,Nadia Carolina; Melo,Cláusio Antônio Ferreira de; Pereira,Jadergudson; Nunes,Glauber Henrique de Sousa; Oliveira,Ohana Luiza Santos de; Corrêa,Ronan Xavier.
Abstract In melon (Cucumis melo) the resistance to Cucumber Mosaic Virus (CMV) and the knowledge about reproductive characteristics are important for selection of genitors for breeding population. So, the objective was to investigate if different accessions of melon from a Brazilian germplasm bank have variability in resistance to CMV (FNY strain) and polymorphism in resistance loci markers, as well as whether there is genetic diversity on resistance and floral morphology descriptors and reproductive biology, aiming at genetic improvement. The symptoms induced by CMV were evaluated in 52 melon genotypes which were genotyped with three markers of single nucleotide polymorphisms related to CMV resistance. A sample of 24 genotypes was characterized for...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Molecular marker; SNP-CAP; Genetic diversity; Floral and reproductive variability; Ward-MLM; CMV.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452019000500405
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Diversidade genética de Chenopodium ambrosioides da região cacaueira da Bahia com base em marcadores RAPD PAB
Santos,Simone Gualberto; Corrêa,Ronan Xavier.
Chenopodium ambrosioides L., conhecida no Brasil por suas propriedades medicinais e usada principalmente para o controle de verminoses intestinais, é pouco estudada quanto à diversidade genética. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de 16 indivíduos de C. ambrosioides, provenientes de diferentes municípios da região cacaueira da Bahia, pela técnica de RAPD (DNA polimórfico amplificado ao acaso). Apenas 6,9% das 216 bandas RAPD amplificadas foram polimórficas e a análise de agrupamento evidenciou que não há formação de grupos por área de coleta. Portanto, há pequena variabilidade entre os materiais e esta variabilidade encontra-se distribuída entre as regiões amostradas.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Variação genética; Marcadores moleculares; Mastruz; Coeficientes de similaridade; Análise de agrupamento; Planta medicinal.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000100022
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Diversidade genética entre acessos de cacau de fazendas e de banco de germoplasma na Bahia PAB
Leal,Jeiza Botelho; Santos,Leonardo Moreira dos; Santos,Crisliane Aparecida Pereira dos; Pires,José Luís; Ahnert,Dário; Corrêa,Ronan Xavier.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de acessos de cacau, selecionados previamente como produtivos e resistentes à vassoura-de-bruxa na Bahia, e estudar suas inter-relações com genótipos no banco de germoplasma. Amostras de DNA de folhas dos 120 acessos, coletados em 17 fazendas de sete municípios do Sul da Bahia, foram amplificadas pela técnica de RAPD ("random amplified polymorphic DNA"). Os coeficientes de dissimilaridade genética, calculados pelo método de Jaccard a partir das bandas RAPD, permitiram evidenciar, pela análise de agrupamento, que a maioria das seleções das fazendas (89,2%) agrupou-se com acessos do banco de germoplasma considerados representativos da diversidade de cacau (híbridos, trinitários, Scavinas,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Theobroma cacao; Marcador molecular; Melhoramento genético; Vassoura-de-bruxa.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000700009
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Marcadores microssatélites relacionados com a resistência à vassoura-de-bruxa do cacaueiro PAB
Santos,Rogério Mercês Ferreira; Lopes,Uilson Vanderlei; Bahia,Rita de Cássia; Machado,Regina Celle Rebouças; Ahnert,Dário; Corrêa,Ronan Xavier.
Os objetivos deste trabalho foram caracterizar a resistência à vassoura-de-bruxa de plantas de cacau originadas do cruzamento entre TSH 1188 e CCN 51 (população segregante), por meio de dois métodos de inoculação em condições de campo, e identificar marcadores microssatélites específicos para grupos de plantas resistentes e suscetíveis. As plantas-controle avaliadas pelos métodos de inoculação natural e inoculação artificial em campo produziram os mesmos padrões de sintomas. As plantas da população segregante também coincidiram os padrões de sintomas em 90%, por esses dois métodos. O método de inoculação artificial em campo permite detectar falso-resistentes. Dos 18 pares de primers microssatélites amplificados, 15 foram polimórficos entre os genitores, e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Theobroma cacao; Moniliophthora perniciosa; Inoculação; Marcador molecular; QTL; Melhoramento genético.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000800010
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RAPD markers linked to a block of genes conferring rust resistance to the common bean Genet. Mol. Biol.
Faleiro,Fábio Gelape; Vinhadelli,Wender Santos; Ragagnin,Vilmar Antonio; Corrêa,Ronan Xavier; Moreira,Maurilio Alves; Barros,Everaldo Gonçalves de.
Rust, caused by the fungus Uromyces appendiculatus, may cause a significant loss to common bean (Phaseolus vulgaris L.) yield. RAPD markers tightly linked to the resistance genes may be used in breeding programs to aid the development of rust-resistant bean cultivars. In this sense, the objective of the present work was to identify RAPD markers linked to a rust resistance gene block present in the cultivar Ouro Negro. Two hundred and fourteen F2 individuals from a cross between the resistant cultivar Ouro Negro and the susceptible cultivar US Pinto 111 were inoculated with a mixture of eight races of U. appendiculatus. The segregation ratio obtained suggested that resistance is monogenic and dominant. Bulked segregant analysis was used in conjunction with...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572000000200027
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